"استعمال BOX-PCR لدراسة التقارب الوراثي لبعض من بكتريا Pseudomonaus aeruginosa المعزولة من مصادرمرضية و بيئية مختلفة في بغداد "

الملخص

تم جمع ست و عشرون عزلة بكتيرية مختلفة من بكتريا Pseudomonas aeuruginosa ، كان منها 16 عزلة مرضية أي 62 % من العدد الكلي للعزلات , معزولة من نماذج مختلفة ( ادرار ، دم ، قشع ، جروح ، مسحات الاذن و العين و البلعوم ) من مستشفى مدينة الطب في بغداد . و كان منها عشرة عزلات بيئية أي 38% من العدد الكلي للعزلات , معزولة من اماكن مختلفة من الماء و التربة في نفس المدينة . شخصت كل العزلات بألاختبارات الباكتريولوجية و البايوكيميائية . تم استخلاص DNA الخام من كل من العزلات المرضية و البيئية . أنجز BOX-PCR بأستخدام البادئ BOX1AR , بعدها تم تحليل ناتج التضخيم BOX-PCR بأستخدام الترحيل الكهربائي الافقي بهلام الاكاروز . تم رسم Dendrogram لكل العزلات بأستخدام معاملان Jaccard و Dice معتمدة – الحزم , اذ أنجزت الطبعة الوراثية لنسق الحزم باستعمال UPGMA , لدراسة التقارب الوراثي بين العزلات المرضية و البيئية . بينت النتائج ان DNA الخام مناسب لأجراء BOX-PCR , و وجود تشابه كبير بين نسق الحزم الناتجه عن التضخيم للعزلات المرضية و البيئية نفسها , و التي كانت بحدود 45 % - 99% و 61% - 100% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي . اما التشابه بين هاتين المجموعتين كان بحدود 40%- 55% حسب المعاملان Jaccard و Dice على التوالي .
بالرغم من العلاقة الملحوظة بين كل من العزلات المرضية و البيئية , استنتجت هذه الدراسة وجود تباين وراثي بين العزلات المرضية و البيئية لهذة البكتريا الأنتهازية بأستخدام تقنية BOX-PCR و بأستخدام البادئ BOX1AR .