استخدم Box -PCR لدراسة الارتباط الجيني لبعض عزلات Pseudomonaus aeruginosa من مصادر إكلينيكية وبيئية مختلفة في بغداد

الملخص

الملخص تم جمع 26 عزلة مختلفة من Pseudomonas aeuruginosa (P. aeruginosa) ، ستة عشر عزلة إكلينيكية (62٪ من المجموعة الكلية) تم عزلها من عينات مختلفة (البول ، الدم ، البلغم ، الجرح ، مسحات الأذن ، العين والحلق) من المسحات الطبية. مستشفى مدينة بغداد ، وعشر عزلات بيئية (38٪ من المجموعة الكلية) كانت معزولة من أماكن مختلفة من التربة والمياه في نفس المدينة. تم تشخيص العزلات بواسطة الاختبارات البكتريولوجية والكيميائية الحيوية. تم استخلاص الحمض النووي الخام من جميع العزلات السريرية والبيئية. تم تحقيق BOX-PCR باستخدام أساس BOX1AR. تم تحليل منتجات BOX-PCR بواسطة الرحلان الكهربائي لهلام الاغاروز الأفقي. تم رسم مخطط الأسنان لجميع العزلات باستخدام معاملات Jaccard و Dice القائمة على النطاق حيث تم إنشاء بصمات الأصابع من خلال أنماط النطاقات باستخدام طريقة المجموعة الزوجية غير الموزونة مع المتوسط ​​الحسابي (UPGMA) ، من أجل دراسة الارتباط بين العزلات السريرية والبيئية. . أظهرت النتائج أن الحمض النووي الخام كان مناسبًا لـ BOX-PCR ، ووجود تشابه كبير في أنماط النطاقات للعزلات السريرية والبيئية ، والتي كانت حوالي 45٪ -99٪ و 61٪ -100٪ في معاملات Jaccard و Dice. على التوالى . كان التشابه بين هاتين المجموعتين حوالي 40٪ و 55٪ في معاملات Jaccard و Dice على التوالي. على الرغم من الارتباط الملحوظ بين جميع العزلات السريرية والبيئية ، فقد خلصت هذه الدراسة إلى وجود اختلاف وراثي بين العزلات السريرية والبيئية لهذه البكتيريا الانتهازية ، باستخدام تقنية BOX-PCR و BOX1AR التمهيدي.